בית הספר חברותא מקנה השכלה רחבה בתחומי הרוח והחברה, המדעים ותרבות ישראל. זאת, תוך העמקה בתכנים הנלמדים, טיפוח ערכים ומתן דגש על הקניית מיומנויות למידה והבעה - בעברית ובאנגלית. המיומנויות שרוכשים התלמידים ומחויבותם העמוקה של המורים להתקדמותו האישית של כל תלמיד, מבטיחים את הצלחת התלמידים בבחינות הבגרות, כמו גם בכל אתגר לימודי בו יעמדו בעתיד.
התלמידים נחשפים למרצים אורחים, מהארץ ומחו"ל, מתחומי המדע, האומנות, החברה והממשל. נוסף על אלה, משקיע בית הספר בפעילות ערכית, חינוכית וחברתית ענפה ומתמשכת ומאפשר לתלמידיו להכיר ולגלות בעצמם מנהיגות.

3,4,5 יח"ל במתמטיקה ו-4,5 יח"ל באנגלית

כימיה, פיסיקה, ספרות, היסטוריה ומדעי החברה (פסיכולוגיה-סוציולוגיה)

עבודות חקר בנושאים שונים (מסלול לתלמידים מצויינים) לתלמידים בעלי יכולות למידה עצמאיות.

בית הספר מכוון ללמידה משמעותית, בה התלמידים לוקחים אחריות על תהליך הלמידה שלהם בעוד המורה מספק להם סביבה מאתגרת, רלוונטית ומפרה. התלמידים יהיו פעילים ויביאו לידי ביטוי את עמדותיהם ורעיונותיהם בכל שלבי הלימוד. הלמידה בבית הספר מתבצעת בסביבות מגוונות. חלק מהשיעורים מתקיים בכיתות בהן לומדים 12-14 תלמידים סביב שולחן עגול-למידת Harkness , או כפי שאנו קוראים לה - למידת חברותא. שיעורים אחרים, מתקיימים בכיתה גדולה יותר, בזוגות ואפילו לבד. תהליך הלמידה מתקיים גם מחוץ לבית הספר – בטבע, במוסדות תרבות, תעשייה, ממשל ועוד, כדי לחשוף את התלמידים לארץ, על מכלול נופיה האנושיים והגיאוגרפיים.

בית הספר רואה עצמו כבית חינוך, השואף שתלמידיו יבנו לעצמם אני-מאמין ייחודי לאור הערכים שספגו משפחותיהם, ממוריהם ומחבריהם. לפיכך, מספק בית הספר סביבה נעימה,  בטוחה, ערכית,  מודרנית מתחדשת,  המאפשרת התפתחות של כל תלמיד באווירה של כבוד הדדי וחדוות למידה. התלמידים לומדים בקבוצות קטנות כשיחס החניכה בין מחנכים לתלמידים גבוה בהרבה מהמקובל. בבית הספר מונהג יום לימודים ארוך הכולל ארוחת צהריים. כך יוכלו להיווצר מפגשים משמעותיים בין המורים לתלמידים ובין התלמידים לבין עצמם. בית הספר יהיה פתוח מעבר לשעות הלימודים הרשמיות ולתלמידים תהיה גישה לספריות, לכיתות ולמחשבים גם בשעות אלו. סיורים, אירוח ולמידה מחוץ לבית הספר יהוו חלק מתכנית הלימודים השנתית בכל התחומים, ובית הספר ילווה ויעודד את תלמידיו לעשייה חברתית באמצעות חשיפה למגוון התנסויות, כלים ומודלים.